大型フェリーはこのページの他に、国際定期船にもあります

航路	船主	船　名
博多〜壱岐〜対馬	九州郵船	ニューつしま
八幡浜〜臼井	九四オレンジフェリー	おれんじ九州
新門司〜泉大津	阪九フェリー	ニューあかし
広島〜呉〜松山観光港	石崎汽船	翔洋丸　・　旭洋丸
広島〜呉〜松山観光港	瀬戸内海汽船	石手川　・　四万十川
呉(阿賀)〜松山(堀江)	呉・松山フェリー	ほりえ丸 ・ Ｃａｍｅｌｌｉａ II ３かめりあ(Sun Camellia)
竹原〜波方	竹原波方間自動車航送船組合	安芸　・　芸予
福山〜多度津（航路廃止）	せとうち物流	おれんじぷりんせす
宇野〜高松	宇高国道フェリー	こくどう丸 ・　りつりん丸 おかやま丸 かがわ丸　・　 国道フェリー
宇野〜高松	四国フェリー	第八十玉高丸 第八十一玉高丸 第八十二玉高丸 第八十五玉高丸 第八十七玉高丸 第七十二玉高丸
宇野〜直島〜高松	四国汽船	なおしま　・　あさひ
宇野〜直島（風戸）	津国汽船	第十一日通丸
宇野〜直島（風戸）	四国汽船	せと
新岡山〜小豆島（土庄）	両備運輸	さんおりんぴあ　・　にゅうおりんぴあ おりんぴあどりーむ
新岡山〜小豆島（土庄）	四国フェリー	第五しょうどしま丸 第一しょうどしま丸
松山〜小倉	関西汽船	フェリーはやとも２
高松〜池田	国際フェリー	第三十一こくさい丸 第三十二こくさい丸 第二十一こくさい丸
高松〜小豆島（土庄）	小豆島急行フェリー	第一しょうどしま丸 第二しょうどしま丸 第七しょうどしま丸
高松〜小豆島（土庄）	内海フェリー	ブルーライン
今治〜大島	協和汽船	第十一おおしま 第十二おおしま
明石〜岩屋	明石淡路フェリー	あさしお丸
神戸〜大阪〜高松	加藤汽船	ぐれいす
神戸〜高松	加藤汽船	りつりん２　・　こんぴら２
神戸〜今治〜松山〜大分	ダイヤモンドフェリー	ブルーダイヤモンド フェリーダイヤモンド
神戸〜今治〜松山	三宝海運	ほわいとさんぽう２
大阪〜神戸〜徳島	徳島阪神フェリー	おとわ丸
大阪南港〜新門司	名門大洋フェリー	フェリーおおさか・フェリーきたきゅうしゅう フェリーきょうと２・フェリーふくおか２
大阪南港〜新居浜/東予	四国開発フェリー	おれんじ８
神戸〜大阪〜奄美〜那覇	マルエーフェリー	琉球エクスプレス
大阪〜神戸〜松山〜別府	関西汽船	さんふらわあこがね・さんふらわあにしき
七類・境港〜隠岐	隠岐汽船	フェリーおき　・ フェリーくにが
小松島〜和歌山	南海フェリー	きい丸
高知〜甲浦〜大阪	大阪高知特急フェリー	フェリー高知（会社倒産のため運行廃止）
東京〜三宅島〜八丈島	東海汽船	すとれちあ丸
熱海〜伊豆大島	東海汽船	かとれあ丸
東京〜徳島〜新門司	オーシャン東九フェリー	おーしゃん　いーすと
稚内〜利尻・礼文	東日本海フェリー	アインス宗谷２　・　ニュー宗谷